MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR

Total Repeats: 324

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009777	GAT	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009777	GAT	2	6	115	120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009777	TGT	2	6	153	158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009777	GAC	2	6	177	182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009777	GCA	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009777	GTC	2	6	307	312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009777	CTT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009777	GTC	2	6	389	394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009777	CTT	2	6	411	416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009777	GA	3	6	579	584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009777	TAT	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009777	TAT	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009777	TTC	2	6	1417	1422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009777	TC	3	6	1540	1545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009777	TTCT	2	8	1546	1553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009777	GGC	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009777	TCC	2	6	2774	2779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009777	TA	3	6	2869	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009777	GC	3	6	2881	2886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009777	AGA	2	6	2895	2900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009777	ACG	2	6	2930	2935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009777	GGC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009777	CGC	2	6	3903	3908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009777	T	7	7	3910	3916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009777	GCG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009777	CT	3	6	4242	4247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009777	TTG	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009777	ATG	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009777	TGA	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009777	GTTG	2	8	4529	4536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009777	CAA	2	6	4537	4542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009777	AAC	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009777	TGG	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009777	TCC	2	6	4940	4945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009777	TA	3	6	5035	5040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009777	GC	3	6	5047	5052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009777	AGA	2	6	5061	5066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009777	ACG	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009777	GGGCA	2	10	5829	5838	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009777	TTC	2	6	5890	5895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009777	GTAT	2	8	5959	5966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009777	TGT	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009777	CTA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009777	CAC	2	6	6022	6027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009777	CT	3	6	6057	6062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009777	GGC	2	6	6066	6071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009777	T	8	8	6072	6079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009777	T	6	6	6084	6089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009777	A	6	6	6153	6158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009777	GGTA	2	8	6162	6169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009777	ACAAG	2	10	7848	7857	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009777	AGA	2	6	7968	7973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009777	A	6	6	7977	7982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009777	T	6	6	7994	7999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009777	TTCGA	2	10	11405	11414	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009777	CTA	2	6	11510	11515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009777	TTC	2	6	11527	11532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009777	CGT	2	6	11543	11548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009777	CCA	2	6	11580	11585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009777	AATT	2	8	11645	11652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009777	TAT	2	6	11655	11660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009777	TTTA	2	8	11674	11681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009777	TAG	2	6	11789	11794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009777	AGC	2	6	12545	12550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009777	CTC	2	6	12556	12561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009777	AAC	2	6	12563	12568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009777	TAT	2	6	14459	14464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009777	TTC	2	6	15164	15169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009777	GTA	2	6	15762	15767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009777	CAG	2	6	15777	15782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009777	AG	3	6	15781	15786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009777	ATCA	2	8	16215	16222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009777	T	7	7	16257	16263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009777	A	6	6	16306	16311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009777	A	6	6	16329	16334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009777	A	6	6	16340	16345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009777	ATTAC	4	20	16360	16379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009777	CGT	2	6	17212	17217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009777	AAG	2	6	17264	17269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009777	CTT	2	6	17300	17305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009777	GTA	2	6	18029	18034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009777	CAG	2	6	18044	18049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009777	AG	3	6	18048	18053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009777	ATCA	2	8	18482	18489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009777	TTC	2	6	18521	18526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009777	AGA	2	6	18807	18812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009777	ATG	2	6	18820	18825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009777	TCT	2	6	18847	18852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009777	ACT	2	6	18875	18880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009777	TGG	2	6	18962	18967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009777	GAG	2	6	19065	19070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009777	GCC	2	6	19091	19096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009777	TCAC	2	8	19169	19176	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009777	GGC	2	6	19344	19349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009777	GAT	2	6	20666	20671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009777	GA	3	6	20683	20688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009777	AGC	2	6	21031	21036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009777	CTC	2	6	21042	21047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009777	AAC	2	6	21049	21054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009777	TCA	2	6	21085	21090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009777	CGC	2	6	21138	21143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009777	CAG	2	6	21190	21195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009777	A	7	7	21205	21211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009777	TGT	2	6	21221	21226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009777	TCT	2	6	22484	22489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009777	TCG	2	6	22501	22506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009777	GGA	2	6	22535	22540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009777	GGT	2	6	22622	22627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009777	AT	3	6	22719	22724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009777	TCT	2	6	23915	23920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009777	TCA	2	6	23991	23996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009777	GT	3	6	25256	25261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009777	AGT	2	6	25378	25383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009777	TCAT	2	8	27034	27041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009777	CTA	2	6	27045	27050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009777	TGC	2	6	27052	27057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009777	A	6	6	27105	27110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009777	CATT	2	8	27137	27144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009777	TAAC	2	8	27149	27156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009777	CTTT	2	8	27446	27453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009777	GA	3	6	27501	27506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009777	TAT	2	6	28065	28070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009777	GAA	3	9	28074	28082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009777	T	6	6	28095	28100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009777	GAA	2	6	28142	28147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009777	TGG	2	6	29289	29294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009777	TAAG	2	8	29346	29353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009777	ATT	2	6	29360	29365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009777	TCAG	2	8	29514	29521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009777	TGC	2	6	29535	29540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009777	ATT	2	6	29591	29596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009777	CTG	2	6	29599	29604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009777	CAA	2	6	35447	35452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009777	GGT	2	6	35515	35520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009777	ACCA	2	8	35571	35578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009777	CCA	2	6	38416	38421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009777	ATA	2	6	38422	38427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009777	T	6	6	38453	38458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009777	A	7	7	38465	38471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009777	GCG	2	6	38481	38486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009777	A	8	8	44385	44392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009777	CTTTCA	2	12	44771	44782	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009777	GT	3	6	44828	44833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009777	TC	3	6	44846	44851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009777	CT	3	6	45075	45080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009777	CT	3	6	45166	45171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009777	TG	3	6	45199	45204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009777	GAG	2	6	45310	45315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.